Давным-давно это с каких времен, не с 18 века случаем? Так называемые тобою "собственные экосистемы" преобразуют часть использованных земель в непригодные для существования нас же.

Остальные не вредят. Они жили до нас и будут жить и без нас так же. Пингвины не оставляют мусора. Комар не оставляет мусора. А по поводу "Жизнь не обязана быть полезной и соответствовать чьим либо ожиданиям", поиграй в Game of Life. Отличный обобщенный пример показывающий что для жизни должны выполняться условия. И чем чревато нарушение.

По поводу мусора и организмов верно подмечено. Вот только мы не едим то что выбрасываем на свалки.