Из моего опыта, бизнес вообще и малый бизнес в частности, любит занижать прибыль, чтобы платить меньше налогов. Иногда доходит до такого, что в принципе с задекларированной прибылью пора начинать процедуру банкротства, собственно именно такие ситуации и вызывают вопросы у ФНС.
Например, малый бизнес очень любит наличку, которую можно и не проводить через ККТ, покупатели всё равно редко берут чек.