Головной мозг и часть спинного всё что нужно системам обеспечения дреда. Было бы логично не оставлять лишние части тела которые либо будут требовать потребления дополнительных веществ либо при их недостаче просто сгниют отравляя другие части.

С учётом того что в Дред запихивают останки марина, зачем ему размер для вмещения его целиком?

Ну я не знаю о каком конкретно персонаже ты говоришь.
Например инквизитор из той же "Ксенологии" когда ему дали сведения о эльдар сказал что-то уровня "Что это за фигня? Да и какая вообще разница, главное то что они в упадке и скоро мы их всех уничтожим".

На сколько я знаю большинство стараются переубедить в бэковости БЛ, а не в нормальности, (хотя тут уже зависит от конкретного произведения).
Если рассматривать книгу аналогично кодексу, где вся инфа 100%-ая, то конечно можно заметить кучу тупой фигни. Но если рассматривать их так как они сами себя позиционируют в заглавии, то есть как мемуары участников, летописи и доклады расследований, а то и вовсе пьяные россказни о былой молодости или Варп-галюны и соответственно принять что персонаж может ошибиться (а сильно ли важно имперцу сильно точно определять вид степных хищников каких-то ксеносов?) то книги гораздо легче воспринимать.
Это конечно можно назвать просто оправданием тупизмов авторов, и в значительных случаях это оно с есть, но, коль другого нет, а полутора строчек из кодекса не хватает, то приходится принимать хоть так.

Мортифакторы смотрят на тебя с неодобрением. Заодно присматриваясь к размеру и форме твоего черепа.

Ну стоит помнить что описание тел ксеносов в "Ксенологии" это теории поехавшего магоса под майндконтролем у которого на одно из первых в Империуме вскрытии и описании подобного рода чужого было меньше одного дня. Так что вполне мог перепутать орган для чувства феромонов (всё таки они тоже частично запахом передаются) с обычным органом нюха.
Ну а касательно лица Шасерры, лица реальных земных женщин солдат сразу после военных операций тоже особой женственностью не отличаются.

Комсток решил что 21-ый век более перспективен для создания райского города?

Как это больше никто не видел?
А труп у входа с надписью "Не слушала речи преподавателя" чей?

Техножрецы потрудились над переводом послания великана, и теперь полковник намеревался донести результаты расшифровки до других офицеров. Архаичное записывающее устройство зазвучало. Бесстрастный механический голос произносил слова на безупречном готике:

«Я владыка и хозяин. Мой народ ходил по этой земле за миллионы лет до того, как ваша раса родилась. Вы выстроили свои города над нами, пока мы спали. Но теперь мы проснулись, чтобы забрать свое. Уходите из этого мира, или мы вас уничтожим».

Что-то уровня того что было в "Мертвецы идут"?
У вас три дня на эвакуацию, а то что у вас нет кораблей для перевозки жителей трёх городов-ульев никого не волнует.