Если я пришел с работы, а напостили на несколько страниц - мне было достаточно открыть страницы до последней виденной мной картинки - или просто обновить страницы, как правило у меня висят 3-4 последних. А сейчас получится непонятно что.

Последняя была как раз 1016, предпоследняя 1015. А 2 она 2 и есть.
Я попробовал по своей ссылке http://anime.joyreactor.cc/tag/%25D1%258D%25D1%2582%25D1%2582%25D0%25B8/all/2 перейти - перешел на 2.
Раньше бы перешел на 1015. То есть раньше последняя цифра в адресной строке показывала насколько далеко она от самой новой - а теперь показывает насколько она от самой первой.
Единственное я последней называю самую новую.

Повторы или пропуски постов на разных страницах.
самое главное я не понял - то ли я что-то случайно накосячил с настройками сайта, то ли поменяли в самом сайте.

В каком разделе? Я сейчас посмотрел - так же отображает.
Единственная мысль - включил случайным нажатием комбинации кнопок обратный порядок страниц - но тут вроде такого нет.

А на фига это надо?

Я просто сохранял страницу как один файл. Потом открываешь и все ссылки активны.

У меня пара страниц висит - периодически обновляю, чтобы посмотреть к каким постам добавили комменты.
Я охренел, когда после обновления второй страницы оказался именно на второй.
К тому же нумерация страниц довольно часто глючит - последняя допустим 1016, я предпоследняя 1014 - а первую на предпоследней видно 1015.
Раньше посты все равно правильно отображались, а сейчас с глюками.